RNA聚合酶由α2ββ’δ五种亚基组成，是全酶的核心成分。大肠杆菌的RNA聚合酶分子量约480000，包含α、β、β’、δ四种不同的多肽，其中α为两个分子，因此全酶的构成为α2ββ’δ。α亚基参与四聚体核心（α2ββ’）的形成，而β亚基则负责结合核苷三磷酸。β’亚基具有与DNA模板结合的功能，而Sigma因子则专门负责转录的起始，与转录链的延伸无关。一旦转录开始，δ因子便会释放，由四聚体核心酶催化转录链的延伸。δ因子的作用在于识别转录起始位置，并使RNA聚合酶结合在启动子部位。
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