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如何合并ESTIMATEScore和生存时间

肿瘤微环境中免疫细胞与基质细胞的比例对预后至关重要，ESTIMATE算法量化评估免疫与基质成分，预测非肿瘤细胞浸润。在肿瘤研究中，免疫评分、基质评分及估计评分提供了关键信息。

免疫评分衡量免疫细胞在肿瘤组织中的浸润，基质评分记录肿瘤组织中基质的存在，而估计评分推断肿瘤纯度。ESTIMATE数据库提供多种肿瘤的StromalScore、ImmuneScore与ESTIMATEScore。

为了整合生存时间数据与ESTIMATE评分，首先从TCGA数据库下载特定肿瘤样本的生存时间数据，参照指南获取RNAseq数据与临床信息。接着，从ESTIMATE数据库获取StromalScore、ImmuneScore与ESTIMATEScore。

整合过程涉及样本ID的匹配，由于生存时间数据ID为12位，而ESTIMATE评分数据ID较长，通过比较前12位ID，找到一致的样本记录，然后合并免疫分值与生存时间数据。实现这一整合可通过编程实现。

具体步骤包括：

下载TCGA生存时间数据。

下载ESTIMATE评分数据。

提取ESTIMATE评分数据中样本ID的前12位。

与生存时间数据进行ID匹配。

合并匹配样本的免疫分值与生存时间数据。

此过程通过编程完成，确保数据准确整合。实现此功能的代码及相关数据获取指南可在线获取。